big data et cancer : l'AP-HP met en place un partenariat avec Quinten

Cancer colorectal : pour collecter et analyser des données et faire avancer la recherche, l'AP-HP met en place un partenariat avec Quinten avec le soutien de Roche

Publié le 17 novembre 2014
big data et cancer : l'AP-HP met en place un partenariat avec Quinten

L'Assistance Publique-Hôpitaux de Paris-AP-HP met en place un partenariat avec Quinten pour la collecte, l'analyse et la mutualisation de données relatives à la prise en charge du cancer colorectal. Le projet COINCIDE, du nom de la cohorte analysée, a pour objectif de mieux appréhender les disparités au sein d'une maladie très hétérogène afin de formuler des propositions visant à améliorer la prise en charge du cancer colorectal opéré en Ile-de -France. Les données* relatives à environ 2000 patients ont ainsi été collectées par une vingtaine de services d'oncologie colorectale de l'AP-HP, ce qui représente au total plus de 300 000 données médicales. L'expertise de Quinten consiste à analyser ces données. Cette analyse permet aujourd'hui d'émettre deux premières hypothèses autour du dépistage et de la chirurgie du cancer colorectal.

Le projet « COINCIDE » : un projet multicentrique inédit

L'analyse des données du projet COINCIDE soutenu par Roche a pour objectif de contribuer à une vision plus juste de la réalité de la prise en charge du cancer colorectal opéré en Ile-de-France. Avec une base de données issue de près de 20 services de l'AP-HP et comprenant 150 paramètres différents sur 2000 patients (soit 300 000 données), l'analyse s'est révélée complexe en raison du volume de données à analyser et de leur hétérogénéité.

« Le challenge de réunir des chirurgiens et d'utiliser les financements de recherche autour d'une collecte de données n'était pas gagné. A force de ténacité et de persuasion, ce projet a pu fédérer des équipes des hôpitaux de l'Assistance-Publique Hôpitaux de Paris et générer une cohorte de 2000 patients » explique le Pr Marc Pocard - responsable de l'activité cancérologie au sein du service de chirurgie digestive du Pr Valeur, Hôpital Lariboisière-AP-HP. « L'analyse de gros volumes de données cliniques est un enjeu important pour la santé publique. Les projets tels que COINCIDE permettent en effet d'évaluer l'impact des stratégies thérapeutiques. Nous avons proposé aux cliniciens le montage de ce partenariat innovant, gagnant pour les médecins chercheurs et in fine, les patients » indique Florence Ghrenassia, Directrice de l'Office du Transfert de Technologie et des Partenariats industriels de l'AP-HP

Faire progresser la cancérologie grâce à l'analyse des données

La société Quinten, grâce à son expérience dans l'analyse de données médicales, a extrait deux premières hypothèses qui pourraient donner lieu à des avancées majeures tant en matière de dépistage que de traitement chirurgical.

  • En plus de l'âge et du sexe, l'Indice de Masse Corporelle serait un critère supplémentaire à prendre en compte pour mieux dépister le cancer colorectal

Les résultats produits par Quinten suggèrent que l'IMC (Indice de Masse Corporelle) serait un facteur de risque de certaines localisations de cancer dans des contextes bien déterminés. En effet, certaines sont particulièrement fréquentes chez des profils de patients en situation de sur ou de sous-poids, en fonction de son âge et de son sexe. Si ce résultat est confirmé, le dépistage connu sous sa forme actuelle pourrait être encore plus efficace.

  • L'analyse standardisée de la pièce opératoire permettra un acte chirurgical plus précis

L'analyse anatomo-pathologique de la pièce opératoire peut être restituée de deux manières distinctes : une retranscription d'un compte-rendu oral non structuré dont le contenu peut varier d'un expert à l'autre, ou un compte-rendu « standardisé » commun à tous les experts. Si les deux continuent de coexister, l'analyse a montré que le compte-rendu « standardisé » permet de récolter un plus grand nombre d'informations importantes, tout en relevant la pertinence de certaines informations des rapports non structurés qui ne figurent généralement pas dans les rapports standardisés. L'analyse a donc permis de compléter le rapport standardisé, ce qui devrait permettre de suivre leurs patients dans de meilleures conditions.

Aujourd'hui Quinten poursuit son travail d'analyse en collaboration avec l'AP-HP dans le cadre d'un suivi à plus long terme de la cohorte COINCIDE. « L'analyse des données de l'étude COINCIDE est à de nombreux égards exceptionnelle. C'est en effet l'une des premières fois qu'autant de services de l'APHP ont mutualisé leurs données dans le cadre d'une cohorte. Ceci s'avère particulièrement intéressant, en particulier pour ce qui concerne l'analyse des disparités géographiques et des différences de pratiques entre les centres hospitaliers » explique Alexandre Templier - co-fondateur de Quinten

La poursuite de ce travail doit en effet permettre d'une part de valider les résultats de cette première analyse et d'autre part d'émettre de nouvelles hypothèses permettant d'améliorer la prise en charge du cancer colorectal.

* la collecte, le traitement et l'utilisation de ces données anonymisées sont réalisées après autorisation de la Commission nationale de l'informatique et des libertés CNIL


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